Dr. Marc Strickert
| Researcher ID: GEQ-8667-2022 |
Forschungsinteressen
- Bioinformatik/Medizininformatik
- Biostatistik
- Programmierung
- Simulation
- Data Science
- High-Performance Computing
- Datenvisualisierung
Auszeichnungen
- 2011 Bestes Ergebnis beim “Dialogue for Reverse Engineering Assessments and Methods” DREAM6 Vorhersage-Wettbewerb
Columbia University Center for Multiscale Analysis of Genomic & Cellular Networks,
IBM Computational Biology Center - 2007 Bestes Poster GABI Status Seminar
Bundesministerium für Forschung, Technologie und Raumfahrt, ehemals: Bundesministerium für Bildung und Forschung
Projekte als Co-Investigator oder weiteres Projektmitglied
- GRK 1564: Bildgebung und -verarbeitung neuer Modalitäten - Multimodale Bild-Akquisition und Analyse für Anwendungen in der Zivilen Sicherheit
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Theoriebildung und Algorithmenentwicklung zur Verarbeitung großer -omics- Datensätze aus der molekularen Biologie
Ministerium für Wissenschaft, Energie, Klimaschutz und Umwelt des Landes Sachsen-Anhalt ()
Ausgewählte Publikationen
- CavSimBase: A Database for Large Scale Comparison of Protein Binding Sites (2016)
- IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering
Journalartikel - Correlation-based embedding of pairwise score data (2014)
- Neurocomputing
Journalartikel - Parsimonious Higher-Order Hidden Markov Models for Improved Array-CGH Analysis with Applications to Arabidopsis thaliana (2012)
- PLoS Computational Biology
Journalartikel - Correlation-maximizing surrogate gene space for visual mining of gene expression patterns in developing barley endosperm tissue (2007)
- BMC Bioinformatics
Journalartikel - Gene expression patterns reveal tissue-specific signaling networks controlling programmed cell death and ABA-regulated maturation in developing barley seeds (2006)
- The Plant Journal
Journalartikel
Publikationen
4 von 4
- High-throughput multi-dimensional scaling (HiT-MDS) for cDNA-array expression data (2005)
- Lecture notes in computer science
Konferenzpaper - Merge SOM for temporal data (2005)
- Neurocomputing
Konferenzpaper - On the generalization ability of GRLVQ networks (2005)
- Neural Processing Letters
Journalartikel - Supervised neural gas with general similarity measure (2005)
- Neural Processing Letters
Journalartikel - Unsupervised recursive sequence processing (2005)
- Neurocomputing
Konferenzpaper - A general framework for unsupervised processing of structured data (2004)
- Neurocomputing
Konferenzpaper - Recursive self-organizing network models (2004)
- Neural Networks
Konferenzpaper - Relevance LVQ versus SVM (2004)
- Lecture notes in computer science
Konferenzpaper - Learning vector quantization for multimodal data (2002)
- Lecture notes in computer science
Konferenzpaper - Rule extraction from self-organizing networks (2002)
- Lecture notes in computer science
Konferenzpaper - Generalized relevance LVQ for time series (2001)
- Lecture notes in computer science
Konferenzpaper
Vorangegangener beruflicher Werdegang
- 03/2016 - 07/2016
Mitarbeiter, Job Coach
Schnelle Wiederintegration von Arbeitssuchenden in den Beruf- Gesellschaft für Wirtschaftsförderung, Ausbildungs- und Beschäftigungsinitiativen mbH
- 01/2015 - 06/2015
Wissenschaftlicher Angestellter, Institut für Lungenforschung, Biomedizinisches Forschungszentrum
Bioinformatikanalysen von qRT-PCR-, TLDA- und RNA-Seq-Daten- Philipps-Universität Marburg
- TransMIT Gesellschaft für Technologietransfer mbH
- 02/2012 - 04/2014
Postdoktorand SYNMIKRO und DFG-Projekt präferenzbasiertes Lernen
Entwicklung von Analysemethoden für Daten aus der synthetischen Mikrobiologie- Philipps-Universität Marburg
- 02/2010 - 01/2012
Postdoktorand, DFG Graduiertenkolleg 1564 'Imaging new modalities'
Entwicklung von Klassifkationsverfahren für Terahertz-Spektroskopiedaten- Universität Siegen
- 01/2009 - 12/2010
Bilaterales Deutsch-Argentinisches Projekt (PI)
Algorithmen-Entwicklung zur Attribut-Selektion in der Chemoinformatik; Austauschprogramm mit Dr. Gustavo Vazquez (BMBF/IB:ARG08/016)- Universidad Nacional del Sur
- Planta Piloto de Ingeniería Química
- 05/2007 - 01/2010
Leiter Forschernachwuchsgruppe Dateninspektion (PI)
Theoriebildung und Algorithmenentwicklung zur Verarbeitung großer -omics- Datensätze aus der molekularen Biologie (Ministerium für Wissenschaft und Kultur Sachsen-Anhalt, XP3624HP/0606T)- Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung
- 09/2004 - 04/2007
Postdoktorand AG Mustererkennung
Methodenentwicklung für Transkriptomanalysen- Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung
- 08/2000 - 01/2005
Ph.D. (Dr. rer. nat.), Institut für Informatik
Arbeit: Self-Organizing Neural Networks for Sequence Processing (s.c.laude)
Gutachter: Prof. Barbara Hammer, Prof. Helge Ritter (TU-Bielefeld)
Gebiet: Lernen mit neuronalen Methoden auf strukturierten Daten- Universität Osnabrück
- 09/1995 - 01/2000
Dipl. Systemwiss., Institut für Umweltsystemforschung
Arbeit: Treatment of Time Series from Ecosystems: Analysis and Modelling by the Example of Daily Rainfall and Runoff Data (sehr gut)
Gutachter: Prof. Michael Matthies (Universität Osnabrück), Prof. Holger Lange (BITÖK, Universität Bayreuth)
Gebiet: Mathematische Modellierung komplexer Systeme- Universität Osnabrück
Weitere Forschungsaktivitäten
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- Ibero-American Conference on Arti cial Intelligence IBERAMIA 2012 (Gutachtertätigkeit)
- Argentine Symposium on Artificial Intelligence ASAI 2012 (Gutachtertätigkeit)
- Workshop of the GI-Arbeitskreis Neuronale Netze and the German Neural Networks Society in connection to DAGM 2011 (Gutachtertätigkeit)
- 11th ACIS International Conference on Software Engineering, Artificial Intelligence, Networking and Parallel/Distributed Computing SNPD 2010 (Gutachtertätigkeit)
- Fachzeitschrift "Bioinformatics" (Gutachtertätigkeit)
- Fachzeitschrift "Biological Cybernetics" (Gutachtertätigkeit)
- Fachzeitschrift "BMC Bioinformatics" (Gutachtertätigkeit)
- Fachzeitschrift "BMC Systems Biology" (Gutachtertätigkeit)
- Fachzeitschrift "Data Mining and Knowledge Discovery" (Gutachtertätigkeit)
- Fachzeitschrift "IEEE Transaction on Neural Networks" (Gutachtertätigkeit)
